中国微生态学杂志收录论文类型主要包括：其他、论著、口腔微生态学、临床研究、妇科微生态学、技术与方法、综述等。
杂志论文要求：
1、参考文献著录：执行GB/T7714—2015《参考文献著录规则》。采用顺序编码制著录，依照其在文中出现的先后顺序用阿拉伯数字标出，并将序号置于方括号中，排列于文后。
2、通信作者著录于文章首页地脚，同时附上通信作者的电子邮箱。
3、注释：注解性内容分附注、脚注和夹注。
4、文稿中使用的名词术语、符号、计量单位要前后一致，符合国家有关标准（SI单位）。
5、来稿应具有较高的理论和应用价值。立题新颖，论点正确，论据充分，条理分明，重点突出，文字精炼，数据可靠，理论联系实际，对于社会实践有正确的指导意义；不违反国家宪法、法律以及基本路线、方针政策。
中国微生态学杂志是由国家卫生健康委员会主管，中华预防医学会;大连医科大学主办的CSCD期刊，影响因子为：1.52。顺应社会的发展，杂志获得了多项荣誉：Caj-cd规范获奖期刊、中国优秀期刊遴选数据库、中国期刊全文数据库（CJFD）、中国学术期刊（光盘版）全文收录期刊、中国科技期刊优秀期刊等。
杂志往期论文摘录展示
肠道细菌相关代谢产物脱氧胆酸的量效和时效对秀丽隐杆线虫生长发育的影响
新疆传统发酵乳品中益生菌的益生特性
孕期增重过多对孕妇肠道菌群及妊娠结局的影响
不同碳水化合物对孤独症患儿肠道菌群体外发酵产生短链脂肪酸的影响
卷曲乳杆菌对三种结肠上皮细胞的粘附性
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