根据最新信息《Journal Of Molecular Modeling》期刊在JCR分区中的排名如下：
按JIF指标学科分区学科为BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY，收录子集：SCIE，位于Q4区，排名243 / 313，百分位22.5%；BIOPHYSICS，收录子集：SCIE，位于Q3区，排名52 / 77，百分位33.1%；CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY，收录子集：SCIE，位于Q3区，排名129 / 230，百分位44.1%；COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS，收录子集：SCIE，位于Q3区，排名101 / 169，百分位40.5%；按JCI指标学科分区在学科为BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY，收录子集：SCIE，位于Q4区，排名246 / 313，百分位21.57%BIOPHYSICS，收录子集：SCIE，位于Q3区，排名55 / 77，百分位29.22%CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY，收录子集：SCIE，位于Q2区，排名115 / 231，百分位50.43%COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS，收录子集：SCIE，位于Q3区，排名116 / 169，百分位31.66%。
投稿咨询| 按JIF指标学科分区 | 收录子集 | 分区 | 排名 | 百分位 |
| 学科：BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY | SCIE | Q4 | 243 / 313 |
22.5% |
| 学科：BIOPHYSICS | SCIE | Q3 | 52 / 77 |
33.1% |
| 学科：CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY | SCIE | Q3 | 129 / 230 |
44.1% |
| 学科：COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS | SCIE | Q3 | 101 / 169 |
40.5% |
| 按JCI指标学科分区 | 收录子集 | 分区 | 排名 | 百分位 |
| 学科：BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY | SCIE | Q4 | 246 / 313 |
21.57% |
| 学科：BIOPHYSICS | SCIE | Q3 | 55 / 77 |
29.22% |
| 学科：CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY | SCIE | Q2 | 115 / 231 |
50.43% |
| 学科：COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS | SCIE | Q3 | 116 / 169 |
31.66% |
这表明该刊在生化与分子生物学领域具有较高的学术影响力和认可度。此外，该刊创刊时间：1995年，影响因子：2.1，出版周期：Irregular、出版商：Springer Berlin Heidelberg以及收录情况等信息也为其学术影响力提供了有力支持。
影响因子：是汤森路透(Thomson Reuters)出品的期刊引证报告(Journal Citation Reports,JCR)中的一项数据，现已成为国际上通用的期刊评价指标，不仅是一种测度期刊有用性和显示度的指标，而且也是测度期刊的学术水平，乃至论文质量的重要指标。
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