重庆出版社前身为成立于1950年的西南人民出版社。由于行政区域和政策的调整，出版社先后经历了“三设三改”。1980年，重庆出版社在真理大标准讨论中恢复重建。

2005年4月，以重庆出版社为优秀组建的重庆出版集团正式成立，成为重庆市唯一的大型综合性出版机构。经过十余年发展与融合，集团经营业务按关联度整合为大众类图书和报刊、教育及衍生产品、贸易与供应链金融、文化地产四大板块，在职员工1300余人，实现了从单一出版社向大型综合文化传媒集团的转变。

历史上，重庆出版社首开全国教辅先河，配合中高考，打造了在全国有巨大影响的“海淀教辅系列”；出版了近6000万字、享誉海内外的“三大书系”：《中国抗日战争时期大后方文学书系》《中国解放区文学书系》《世界反法西斯文学书系》；在全国出版界率先设立重庆出版社“科学学术著作出版基金”，迄今资助出版了百余部重大科学学术著作；长期支持马克思主义中国化理论研究工作，出版了以《国外马克思主义和社会主义研究丛书》等为代表的数百部理论研究和普及性读物，产生了重大社会影响。

重庆出版集团成立后，确立了“做强主业，做大产业，产业反哺主业，增强优秀竞争力”的指导思想，实施走出去、多元化、股份制三大战略。集团精心打造《马-恩-列画传》《中华大典》（天文典、地学典）《中国抗战大后方历史文化丛书》《大足石刻全集》《昆仑植物志》等重大出版项目；集团已与30多个国家和地区建立国际出版合作关系，作为中国大陆出版机构唯一代表参与了全球出版项目“重述神话”，使中国文化真正融入西方主流文化圈；策划出版《忠诚与背叛》《藏地密码》《冰与火之歌》等一大批脍炙人口的优秀出版物，畅销大江南北……做大文化产业，多元并举延伸出版产业链。集团大胆吸收国企、民营、外资等社会力量共同投入文化产业，打造重庆出版传媒创意中心、重庆天健创意产业基地等文化创意产业大基地；集团积极推动传统出版与新兴出版融合发展，推进基于移动互联网自助出版发行平台等一系列部级重大项目，成为全国第二批数字出版转型示范单位。

重庆出版社经国家新闻出版总署、重庆市人民政府批准，经重庆市工商局注册登记，于2005年4月正式成立。